Pendekatan DNA Barcoding untuk Identifikasi Cassidula angulifera (Petit, 1841) (Moluska: Gastropoda)

Abstrak

Banyaknya spesies gastropoda yang memiliki kemiripan morfologi (cryptic) membuat kesalahan identifikasi sangat mungkin terjadi. Identifikasi spesies yang akurat sangat diperlukan dalam mempelajari bioekologi spesies. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi spesies Cassidula sp. yang dikoleksi dari Pantai Payum Merauke dengan teknik DNA barcoding menggunakan marka gen COI. Primer yang digunakan dalam penelitian ini adalah primer forward (LCO1490) dan primer reverse (HCO2198). Hasil identifikasi dengan DNA barcoding, spesies yang dianalisis adalah Cassidula angulifera dengan tingkat kemiripan 99.53 % dengan  panjang sekuen DNA 650 bp. Rekonstruksi filogenetik memperlihatkan seluruh sekuen Cassidula sp. yang dianalisis terpisah berdasarkan jenis dan jarak genetik dengan nilai boostrap yang tinggi. Rekonstruksi filogenetik Cassidula sp. membentuk kelompok monofiletik yang berarti spesies tersebut berasal dari tetua yang sama. DNA barcoding sangat baik dan akurat dalam mengidentifikasi spesies.